实际上，关于益生菌的效果与争论，其背后是肠道菌群机制研究的持续争议。
一方面，肠道菌群被认为研究前景广阔，目前，炎症性肠病、癌症、糖尿病、肥胖症、动脉粥样硬化、脂肪肝病、营养不良、自闭症、阿尔茨海默症、抑郁症、哮喘等疾病都被认为与肠道菌群有关。但另一方面，肠道菌群在作用机制与许多具体疾病上都还很模糊，故有调侃称：“遇事不决，量子力学；机制难寻，肠道菌群。”
实际上，由于微生物组的复杂性，将其与某种疾病确定为因果关系变得极具挑战性。
美国微生物科学院fellow、新泽西州立罗格斯大学讲席教授赵立平在接受《知识分子》采访时表示，直到现在，微生物组领域的研究还是以测序为主。如果想做某种疾病和微生物组的关系，最快的方式就是采集病人和健康人的粪便样品，经测序以后分析健康人和病人的粪便菌群有什么不同，把这些变化写成论文发表。
不过，他也指出：“现在这种文章多如牛毛，但做的都是相关性分析——只能说明病人和健康人菌群不一样。而这一差异是发病的原因，还是发病的结果？如果不继续研究下去，就失去了意义。“此外，赵立平还指出，大多数实验室在很多关键的技术问题上还很粗糙，在菌群采样、数据库建构、分析方法上都存在改进空间。
他认为，每个研究菌群的实验室都应该有临床医学、微生物学，生物信息及生物统计学这三个方面的技术储备，“肠道菌群研究非常有前途，它的重要性超出我们现在的想象。但这个领域要想发展好，起码还需要10年的时间。”赵立平认为。 |
